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📅 最終更新日：2026年4月27日｜本記事は最新の税制・拠出限度額に基づき継続的にアップデートされています。
研修医の税金の仕組み｜まず自分の年収を把握しよう
初期研修医（1〜2年目）の年収は病院によって異なりますが、おおよそ300〜500万円が相場です。
| 研修医の種類 | おおよその年収 | 所得税率の目安 |
|---|---|---|
| 大学病院・国公立 | 300〜380万円 | 10〜20% |
| 市中病院（プログラム） | 400〜550万円 | 20%前後 |
| 初期研修＋アルバイト | 500〜700万円 | 20〜23% |
この年収帯は所得税率10〜20%の範囲。節税の効果がしっかり出るレンジです。
また、研修医はアルバイト（バイト）をしている場合、確定申告が必要になるケースがあります。これを知らずに放置すると、追徴課税のリスクがあるので注意が必要です。
研修医の節税①｜iDeCoで所得控除を最大活用する
研修医が取り組むべき節税の筆頭はiDeCo（個人型確定拠出年金）です。
iDeCoの掛金は全額所得控除になります。研修医（勤務医）の場合、月額最大2万3,000円（年27.6万円）まで拠出できます。
| iDeCo掛金（月額） | 年間控除額 | 年収400万円での節税額（税率20%） |
|---|---|---|
| 5,000円 | 6万円 | 約1.2万円 |
| 1万円 | 12万円 | 約2.4万円 |
| 2万3,000円（上限） | 27.6万円 | 約5.5万円 |
さらに運用益が非課税で、60歳以降の受取時にも優遇があります。研修医のうちから始めると、40年間の複利効果で資産形成の差が大きく広がります。
私が研修医に強くすすめる証券会社は松井証券です。iDeCoの手数料が業界最安水準で、運用商品も充実しています。
📚 複利でいくら増えるかの詳細試算は iDeCoは20年で310万円の差｜医師の複利シミュレーション完全版 で解説しています。
研修医の節税②｜ふるさと納税で返礼品を受け取る
ふるさと納税は実質2,000円の自己負担で返礼品がもらえる節税制度です。研修医でも活用できます。
年収別の目安限度額（独身・扶養なしの場合）：
| 研修医の年収 | ふるさと納税の目安上限 |
|---|---|
| 300万円 | 約2.8万円 |
| 350万円 | 約3.4万円 |
| 400万円 | 約4.2万円 |
| 500万円 | 約6.1万円 |
ワンストップ特例制度を使えば確定申告不要（給与所得のみ・5自治体以内の場合）。アルバイトで確定申告が必要な場合はそちらに合算することで還付が受けられます。
研修医の節税③｜特定支出控除で研修費・書籍費を控除する
特定支出控除は、給与所得者が仕事に必要な費用を控除できる制度です。研修医には特に使いやすい制度です。
研修医が控除できる主な支出：
- 研修費・学会参加費（業務に必要な場合）
- 医学書・参考書の購入費
- 資格取得費用（医師免許更新等）
- 通勤費（会社が支給していない分）
- 転居費用（研修先への引越し等）
ポイントは「給与所得控除額の2分の1を超えた分」が控除対象になる点です。年収400万円なら給与所得控除は154万円なので、77万円を超えた特定支出が控除対象になります。
まずは領収書を必ず保管しておくことが重要です。研修医のうちから習慣づけておきましょう。
研修医の節税④｜アルバイト収入は確定申告で取り戻す
研修医がアルバイト（スポットバイト・非常勤）をしている場合、確定申告が必要になります。
アルバイト先では通常「甲欄」か「乙欄」で源泉徴収されます。乙欄適用の場合、源泉徴収が多めに引かれていることがほとんど。確定申告をすれば過払い分が還付されます。
確定申告でできること：
- iDeCoの掛金控除を申告する
- ふるさと納税の控除を申告する
- 医療費控除・生命保険料控除を合算する
- アルバイト源泉徴収の過払い分を還付する
確定申告はe-Tax（電子申告）で自宅から完結できます。マイナンバーカードがあれば5分で完了するケースも。ぜひ習慣にしてください。
研修医の節税⑤｜生命保険料控除で年4万円の控除を得る
生命保険に加入している場合、生命保険料控除を活用できます。
| 保険の種類 | 控除上限額（所得税） |
|---|---|
| 一般生命保険 | 4万円 |
| 介護・医療保険 | 4万円 |
| 個人年金保険 | 4万円 |
最大12万円の所得控除が可能ですが、税率20%なら節税額は最大2.4万円程度です。
ただし、保険は節税だけを目的に加入するのはNG。必要な保障を確認してから選ぶのが基本です。研修医の場合、勤務先の共済保険が充実していることも多いので、まず確認しましょう。
研修医の節税まとめ｜今すぐやるべき優先順位
| 節税手段 | 効果 | 手間 | 優先度 |
|---|---|---|---|
| iDeCo | 年5〜6万円節税 | 口座開設のみ | ★★★ |
| ふるさと納税 | 返礼品＋節税 | ワンストップ特例で簡単 | ★★★ |
| 確定申告（アルバイト） | 還付数万円 | e-Taxで完結 | ★★★ |
| 特定支出控除 | 条件次第で大きい | 領収書管理が必要 | ★★☆ |
| 生命保険料控除 | 年1〜2万円節税 | 年末調整で完結 | ★★☆ |
研修医のうちから節税の習慣をつけておくと、専攻医・スタッフ医になったときに大きな差が生まれます。
特にiDeCoは始める年齢が早いほど有利です。研修1年目から始めた場合と5年後に始めた場合では、60歳時点での資産額に数百万円の差が出ることも。
まずはiDeCoの口座開設から始めてみてください。松井証券なら手続きが簡単で、運用コストも最安水準です。
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よくある質問（FAQ）｜研修医の節税について
Q1. 研修医（年収300〜500万円）でもiDeCoはやるべき？
結論：やるべきです。年収300万円台でも所得税率5〜10%＋住民税10%で、年5〜6万円の節税効果があります。何より「投資の習慣を早く身につける」こと自体が、専攻医・指導医時代に高所得を稼ぐようになったときの判断力に効いてきます。
Q2. ふるさと納税とiDeCo、どちらを優先すべき？
研修医の場合、ふるさと納税が先。理由は：(1) 当年に効果が出る（iDeCoは引出時のメリット込み）、(2) 返礼品の生活コスト削減効果が大きい、(3) iDeCoは60歳まで引出不可なので、まずは現金フローを安定させてから。
Q3. アルバイト収入は確定申告すべき？
はい、必須です。給与とアルバイトの両方がある場合、所得税が源泉徴収されすぎていることが多く、確定申告で数万円〜数十万円が還付されるケースが普通にあります。e-Taxで30分程度で完了します。
Q4. 特定支出控除は研修医にも使える？
使えますが、ハードル高めです。給与所得控除の1/2（年収400万円なら約75万円）を超える研修費・書籍代が必要なため、多くの研修医では実用性は低いのが現実。それより、職場で経費精算できないか相談するほうが先です。
Q5. 学生時代の奨学金返済中でも、節税より返済優先？
金利による判断です。日本学生支援機構の第二種奨学金（金利0.2〜1.0%）程度なら、節税して投資（年4〜7%期待）したほうが理論上有利。利率が高い場合（民間ローン3%以上）は返済優先が無難です。
研修医になったばかりで「節税なんてまだ早い」と思っていませんか？
実は研修医こそ節税を始めるべきタイミングです。年収300〜400万円台の研修医でも、正しい節税をすれば年間10〜20万円の手取りアップが狙えます。
この記事では、脳外科医の私（Dr.GOLF）が研修医時代から実践してきた節税方法を5つ解説します。
公的データの出典｜数字の根拠を明示
本記事の節税額・拠出限度・控除額は以下の公的サイトに基づいて記載しています。
| 項目 | 出典 | 主要データ |
|---|---|---|
| iDeCoの拠出限度額 | iDeCo公式サイト（国民年金基金連合会） | 研修医（厚生年金加入の勤務医）：月23,000円／年27.6万円（2024年12月以降の改正で段階的に引上げ予定） |
| 所得控除の仕組み | 国税庁「小規模企業共済等掛金控除」 | iDeCo拠出額は全額所得控除 |
| 特定支出控除（医師の研修費・書籍） | 国税庁「給与所得者の特定支出控除」 | 給与所得控除の1/2を超える部分を控除可能 |
| ふるさと納税の控除上限 | 総務省 ふるさと納税ポータルサイト | 給与収入と家族構成で控除上限額シミュレーション可能 |
| 生命保険料控除 | 国税庁「生命保険料控除」 | 新制度：一般・介護医療・個人年金で各最大4万円（合計12万円） |
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